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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/21 |
結構生物之內容介紹: 結構生物學內容以及其在現代生命科學之功能和角色。 |
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第2週 |
9/28 |
結構生物學之基本知識(一): 蛋白質的最基本組合方塊—胺基酸以及有多種風貌的蛋白結構。 |
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第3週 |
10/05 |
結構生物學之基本知識(二): 結構生物學之研究工具—包括解析蛋白結晶之方法、蛋白結構展示和分析軟體、各式的生物資訊(bioinformatics)分析資源。 |
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第4週 |
10/12 |
蛋白各級結構和其四大主要功能(一): 蛋白之各級結構詳論、結構功能區塊(functional domain)、蛋白之形變(conformational change)、結構之作用小單位(motif)以及結構間的作用力。 |
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第5週 |
10/19 |
蛋白各級結構和其四大主要功能(二): 蛋白結構和以下四大主要功能之探討: 1. 蛋白結合(binding), 2. 功能催化(catalysis), 3. 結構變化樞鈕(switching), 4. 生物組織之構成(structural proteins)。 |
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第6週 |
10/26 |
結構生物學之研究方法和工具(一) —結構之決定: X-ray 結晶繞射法、核磁共振法 (NMR)、電子顯微鏡影像分析法 (single particle analysis)以及其他傳統生物化學方法。 |
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第7週 |
11/02 |
結構生物學之研究方法和工具(二) —結構之展示和分析: PDB 蛋白結構檔案格式之詳論、蛋白結構之3D展示、蛋白結構之資訊分析、電腦軟體之獲得和使用: 包括 DeepView, Chimera, PyMol, MolMol 2k.2 等軟體。 |
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第8週 |
11/09 |
結構生物學之研究方法和工具(三) — 蛋白順序之比對、分析和結構之預測: Blast 和SMART 結構比對網站, Clustal V, W。 |
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第9週 |
11/16 |
期中考 |
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第10週 |
11/23 |
蛋白結構之形成、摺疊(folding)和蛋白品質之控制。 |
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第11週 |
11/30 |
蛋白結構預測和生物環境對蛋白功能之影響 |
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第12週 |
12/07 |
以結構生物觀點看生命科學(一): 細胞內的生理 |
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第13週 |
12/14 |
以結構生物觀點看生命科學(二): 膜蛋白專論 |
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第14週 |
12/21 |
以結構生物觀點看生命科學(三): 光感系統 |
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第15週 |
12/28 |
以結構生物觀點看生命科學(四): G-蛋白系統 |
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第16週 |
1/04 |
以結構生物觀點看生命科學(五): 大腸桿菌化學感應系統(chemotaxis two component system)
結構生物學的未來動向和生物科技應用 |